Visualização de árvores filogenéticas
Series: Árvores filogenéticas e R
Tutorial para visualizar árvores filogenéticas usando o pacote ggtree do R.
Tutorial para visualizar árvores filogenéticas usando o pacote ggtree do R.
Nossa meta é prover uma introdução básica da linguagem de programação R, que é extremamente poderosa para manipulação de dados, análises estatísticas, produção de gráficos e de documentos dinâmicos, e cujo domínio oferece um grande ganho de produtividade a todo cientista e facilita o entendimento de métodos analíticos. Ressaltamos que isto não é um curso de estatística.
Ensina como unir diferentes tabelas de dados utilizando colunas em comum entre duas tabelas como identificadores, utilizando a função merge() do pacote base do R em conjunto com vetores lógicos.
Descreve todos os passos para plotar o mapa publicado em Rodrigues et al. 2017 com o uso da função layout para compor um mapa em R.
Descreve passos para se plotar um mapa em R, desde a obtenção e manipulação dos dados até a plotagem
Descreve todos os passos para plotar o mapa publicado em Farroñay et al. 2018.